Klasifikasi Tanaman secara botani dibedakan berdasarkan morfologi dan struktur bunga, tanaman berumah satu dan berumah dua.
Pengelompokkan ini dianggap pengelompokan modern yang digunakan secara umum diseluruh dunia. Tiap tanaman dibedakan atas dua namaan ciri primer yaitu nama genera dan nama spesies dalam bahasa latin. Urutan pengelompokkan tersebut adalah : Kingdom, Divisio, Klas, Ordo, Family, dan Genera yang seluruhnya disebut taxa mayor, sedangkan spesies dan varietas disebut taxa minor.
Kingdom dibagi menjadi dua yaitu Kingdon hewan dan kingdom tanaman. Kingdom tanaman dibagi menjadi beberapa divisio. Divisio disebut juga phyta (tumbuhan). Ada empat Divisio terbesar yaitu Tallophyta, Bryophyta, Pteridophyta, dan Spermatophyta.
- Tallophyta adalah tumbuhan yang paling sederhana seperti jamur algae dan lichenes.
- Bryophyta meliputi lumut hati, dan lumut kerak
- Pteridophyta mencakup paku resam, paku ekor kuda, semuanya tergolong tumbuhan tidak berbunga yang paling tinggi
- Spermatophyta meliputi tumbuhan berbiji, yang dikenal dengan tumbuhan tingkat tinggi, tumbuhan dalam golongan ini merupakan tumbuhan yang mengalami evolusi paling akhir.
Spermatophyta terdiri atas dua kelas yaitu Gymnospermae dan Angiospermae. Gymnospermae merupakan tanaman berbiji terbuka, banyak diantaranya terdapat dalam bentuk kerucut, contoh cemara, pinus, dan melinjo. Angiospermae adalah tumbuhan yang memiliki biji tertutup, golongan ini mendominasi spesies tumbuhan tingkat tinggi.
Kelas Angiospermae dibagi menjadi dua sub kelas yaitu Monokotil dan Dikotil. Monokotil adalah tumbuhan yang memiliki satu kotiledon atau keping biji meliputi semua jenis rumputan, pisang, bawang, palm, tulip, anggrek, lili, gladiol dan alang-alang. Dikotiledon adalah tumbuhan yang memiliki dua keping biji termasuk didalamnya tanaman legume, kapas, tembakau, tomat, kubis, wortel, ketela rambat.
Setiap kelas atau sub kelas dibagi dalam beberapa Ordo, dan Ordo adalah kelompok tanaman yang memiliki karakteristik yang sama, nama latin Ordo berakhiran ales, contohnya Graminales.
Setiap ordo dibagi dalam beberapa Family, dan ini merupakan kelompok tanaman dengan kategori yang paling alamiah dan yang paling berguna. Sebagian besar famili berakhiran aceae, asee-ee atau hanya ee.
Beberapa famili terbesar adalah
- Gramineae (Rumput-rumputan),
- Leguminosae (Polongan),
- Solanaceae (berbunga terompet),
- Rosaceae (Rosa) Contoh apel, plum, pear,
- Cruciferace (Sawi-sawian),
- Compacitae contoh aster, bunga matahari, seruni
- Malvaceae (kapas-kapasan),
- Liliaceae (bawang-bawangan),
- Convolvulaceae (berbunga cerobong) contoh ubi jalar.
- Chenipodiaceae (kaki angsa) contoh bayam.
- Palmae (palm),
- Rutaceae (jeruk-jerukan).
- Orchidaceae, Iridaceae (iris contoh gladiol),
- Umbiliferae (bunga berbentuk payung contoh wortel, seledri).
Genus (jamak = genera) dan spesies, nama-nama untuk kedua kategori ini menjadi nama botani atau nama ilmiah tanaman yang ditulis dalam bahasa latin tetapi tanpa akhiran yang seragam.